يكمن دور فني التعقيم الطبي في تعقيم الأدوات والمعدات والأجهزة الطبية لضمان توفر أجهزة ومعدات طبية قابلة لإعادة الاستخدام، ومعرفة كيفية التعامل مع الأجهزة وطرق المحافظة عليها وتخزينها مع ضمان تطبيق أعلى معايير السلامة.
· تخريج فنيي تعقيم طبي مؤهلين علمياً وعملياً في جمهورية مصر العربية و خارجها .
· إتقان المهارات الفنية اللازمة لمكافحة العدوى للارتقاء بجودة الرعاية الصحية في جمهورية مصر العربية .
· رفع جودة قطاع التعقيم ورفع جودة الخدمات المقدمة في القطاع الخاص والعام.
· كوادر فنية مؤهلة ومُلمة بالإجراءات المرتبطة بالتعقيم الطبي مثل: المراقبة البيولوجية.
· كوادر فنية مؤهلة قادرة على إعادة معالجة الأدوات والمعدات الطبية وفقًا للمعايير المطلوبة، ولديها المعرفة التامة بأنواع المنظفات والمطهرات والمعقمات والفرق بينها.
و بذلك يوفر برنامج التعقيم كوادر متخصصة في مجال التعقيم الطبي والمعدات الطبية كما يوفر البرنامج بيئة تعليمية متميزة تجمع بين المعرفة النظرية والتطبيق العملي باستخدام أحدث التقنيات والأساليب.
يركز البرنامج على تعزيز المهارات اللازمة لفهم وممارسة إجراءات التعقيم وضمان الالتزام بمعايير الجودة والسلامة العالمية. كما يسعى البرنامج إلى تطوير قدرات الطلاب في مجالات إدارة المخاطر والسلامة المهنية والمساهمة الفعّالة في تحسين جودة الخدمات الصحية.